MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 120519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019695	CGATCG	2	12	6	17	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019695	CAG	2	6	75	80	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019695	GGT	2	6	82	87	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019695	CTT	2	6	160	165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205074
5	NC_019695	GCTC	2	8	378	385	0 %	25 %	25 %	50 %	428205074
6	NC_019695	TAC	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205074
7	NC_019695	CAA	2	6	425	430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205074
8	NC_019695	GCC	2	6	437	442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205074
9	NC_019695	GTAT	2	8	458	465	25 %	50 %	25 %	0 %	428205074
10	NC_019695	GTC	2	6	477	482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
11	NC_019695	TGC	2	6	506	511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
12	NC_019695	GA	3	6	539	544	50 %	0 %	50 %	0 %	428205074
13	NC_019695	GGC	2	6	567	572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205074
14	NC_019695	ACGA	2	8	672	679	50 %	0 %	25 %	25 %	428205074
15	NC_019695	TGC	2	6	734	739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
16	NC_019695	TTA	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205074
17	NC_019695	GAT	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205074
18	NC_019695	AAG	2	6	793	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205074
19	NC_019695	T	6	6	801	806	0 %	100 %	0 %	0 %	428205074
20	NC_019695	CCAAA	2	10	867	876	60 %	0 %	0 %	40 %	428205074
21	NC_019695	GATT	2	8	919	926	25 %	50 %	25 %	0 %	428205074
22	NC_019695	GCC	2	6	938	943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205074
23	NC_019695	A	7	7	973	979	100 %	0 %	0 %	0 %	428205074
24	NC_019695	TATTTC	2	12	1091	1102	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428205074
25	NC_019695	GCT	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
26	NC_019695	TGA	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205074
27	NC_019695	GTC	2	6	1191	1196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
28	NC_019695	ATG	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205074
29	NC_019695	AG	3	6	1248	1253	50 %	0 %	50 %	0 %	428205074
30	NC_019695	GAA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205074
31	NC_019695	ACC	2	6	1350	1355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205074
32	NC_019695	GCATTA	2	12	1438	1449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428205074
33	NC_019695	GTT	2	6	1497	1502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019695	CT	3	6	1546	1551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019695	CTT	2	6	1691	1696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205075
36	NC_019695	GCA	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205075
37	NC_019695	GAGC	2	8	1827	1834	25 %	0 %	50 %	25 %	428205075
38	NC_019695	GTAG	2	8	1860	1867	25 %	25 %	50 %	0 %	428205075
39	NC_019695	TAC	2	6	1871	1876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205075
40	NC_019695	CCG	2	6	1903	1908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205075
41	NC_019695	CAA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205075
42	NC_019695	CGA	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205075
43	NC_019695	GCTC	2	8	2023	2030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_019695	T	6	6	2039	2044	0 %	100 %	0 %	0 %	428205076
45	NC_019695	ACG	2	6	2142	2147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205076
46	NC_019695	GGC	2	6	2224	2229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205076
47	NC_019695	A	6	6	2260	2265	100 %	0 %	0 %	0 %	428205076
48	NC_019695	AAC	2	6	2427	2432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205076
49	NC_019695	AGC	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205076
50	NC_019695	GAG	2	6	2545	2550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205076
51	NC_019695	GTT	2	6	2551	2556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205076
52	NC_019695	A	7	7	2580	2586	100 %	0 %	0 %	0 %	428205076
53	NC_019695	ATC	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205076
54	NC_019695	AT	3	6	2677	2682	50 %	50 %	0 %	0 %	428205076
55	NC_019695	TGT	2	6	2689	2694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205076
56	NC_019695	GAA	2	6	2707	2712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205076
57	NC_019695	ATT	2	6	2717	2722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205076
58	NC_019695	CGC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205076
59	NC_019695	TAC	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205076
60	NC_019695	CTT	2	6	2952	2957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205076
61	NC_019695	T	6	6	3011	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	428205076
62	NC_019695	ATG	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
63	NC_019695	TAG	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
64	NC_019695	GAT	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
65	NC_019695	AATC	2	8	3220	3227	50 %	25 %	0 %	25 %	428205076
66	NC_019695	CGA	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205076
67	NC_019695	CTT	2	6	3435	3440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205076
68	NC_019695	GTC	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205076
69	NC_019695	GTA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
70	NC_019695	AGA	2	6	3504	3509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205076
71	NC_019695	GAG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205076
72	NC_019695	TTG	2	6	3574	3579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205076
73	NC_019695	TTAC	2	8	3608	3615	25 %	50 %	0 %	25 %	428205076
74	NC_019695	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205076
75	NC_019695	CTG	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205076
76	NC_019695	AGT	2	6	3800	3805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019695	GT	3	6	3815	3820	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019695	TTCG	2	8	3843	3850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019695	CGC	2	6	3922	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_019695	TGT	2	6	3980	3985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019695	ATCG	2	8	4003	4010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019695	TCTA	2	8	4086	4093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019695	ACT	2	6	4102	4107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019695	AAG	2	6	4224	4229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019695	GTT	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019695	CTG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019695	GTTT	2	8	4341	4348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019695	CAG	2	6	4574	4579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019695	TCAAC	2	10	4640	4649	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_019695	ACT	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019695	GAAA	2	8	4719	4726	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019695	ACAA	2	8	4731	4738	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019695	AG	3	6	4781	4786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019695	GAT	2	6	4815	4820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019695	AGA	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019695	CTGG	2	8	5051	5058	0 %	25 %	50 %	25 %	428205078
97	NC_019695	CAC	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205078
98	NC_019695	GAT	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205078
99	NC_019695	GGT	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205078
100	NC_019695	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205078
101	NC_019695	GGT	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205078
102	NC_019695	AGC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205078
103	NC_019695	ACCT	2	8	5425	5432	25 %	25 %	0 %	50 %	428205078
104	NC_019695	AAG	2	6	5518	5523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205078
105	NC_019695	AGA	2	6	5636	5641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205078
106	NC_019695	CCG	2	6	5645	5650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205078
107	NC_019695	TAGT	2	8	5810	5817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019695	CGGG	2	8	5858	5865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019695	TCT	2	6	5878	5883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019695	GTT	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019695	CCT	2	6	6144	6149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205079
112	NC_019695	CCA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205079
113	NC_019695	GA	3	6	6217	6222	50 %	0 %	50 %	0 %	428205079
114	NC_019695	CAG	2	6	6256	6261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205079
115	NC_019695	TGT	2	6	6324	6329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205079
116	NC_019695	GTT	2	6	6331	6336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205079
117	NC_019695	CGG	2	6	6406	6411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205079
118	NC_019695	TCC	2	6	6449	6454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205079
119	NC_019695	TGC	2	6	6455	6460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205079
120	NC_019695	TGC	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205079
121	NC_019695	AGC	2	6	6573	6578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019695	ATCG	2	8	6586	6593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019695	ATC	2	6	6679	6684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019695	AAGTAT	2	12	6699	6710	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019695	AAG	2	6	6749	6754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019695	AGA	2	6	6765	6770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019695	A	6	6	6789	6794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019695	TTA	2	6	6925	6930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019695	TAT	2	6	6941	6946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019695	AT	4	8	6979	6986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019695	TCC	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019695	A	6	6	7088	7093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019695	TTCT	2	8	7126	7133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019695	A	6	6	7141	7146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019695	GAAAC	2	10	7154	7163	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019695	GAT	2	6	7237	7242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019695	TAGGA	2	10	7262	7271	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019695	GCA	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205080
139	NC_019695	ATG	2	6	7389	7394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205080
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269	NC_019695	GA	3	6	13068	13073	50 %	0 %	50 %	0 %	428205083
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400	NC_019695	TCT	2	6	20062	20067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205089
401	NC_019695	CCT	2	6	20076	20081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205089
402	NC_019695	TTC	2	6	20095	20100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205089
403	NC_019695	CAGC	2	8	20169	20176	25 %	0 %	25 %	50 %	428205089
404	NC_019695	AAGC	2	8	20188	20195	50 %	0 %	25 %	25 %	428205089
405	NC_019695	ATC	2	6	20215	20220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205089
406	NC_019695	TGA	2	6	20263	20268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205089
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408	NC_019695	CAA	2	6	20417	20422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205089
409	NC_019695	TCGG	2	8	20450	20457	0 %	25 %	50 %	25 %	428205089
410	NC_019695	CT	3	6	20480	20485	0 %	50 %	0 %	50 %	428205089
411	NC_019695	AGC	2	6	20635	20640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205089
412	NC_019695	TGC	2	6	20722	20727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205089
413	NC_019695	CACG	2	8	20794	20801	25 %	0 %	25 %	50 %	428205089
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432	NC_019695	TAG	2	6	21619	21624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205089
433	NC_019695	ATT	2	6	21633	21638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205089
434	NC_019695	CTG	3	9	21688	21696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205089
435	NC_019695	GGAT	2	8	21707	21714	25 %	25 %	50 %	0 %	428205089
436	NC_019695	CAA	2	6	21716	21721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205089
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440	NC_019695	CAA	2	6	21988	21993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_019695	CAA	2	6	22004	22009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_019695	A	6	6	22008	22013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_019695	AAC	2	6	22097	22102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205090
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455	NC_019695	A	6	6	22651	22656	100 %	0 %	0 %	0 %	428205090
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462	NC_019695	ATCG	2	8	22839	22846	25 %	25 %	25 %	25 %	428205090
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485	NC_019695	CAA	2	6	23853	23858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205090
486	NC_019695	AGAA	2	8	23875	23882	75 %	0 %	25 %	0 %	428205090
487	NC_019695	T	6	6	23926	23931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_019695	CTG	2	6	23965	23970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_019695	TTA	2	6	24033	24038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205091
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492	NC_019695	AATT	2	8	24382	24389	50 %	50 %	0 %	0 %	428205091
493	NC_019695	GCAA	2	8	24408	24415	50 %	0 %	25 %	25 %	428205091
494	NC_019695	TTA	2	6	24577	24582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205092
495	NC_019695	TGT	2	6	24597	24602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205092
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498	NC_019695	GATG	2	8	24741	24748	25 %	25 %	50 %	0 %	428205092
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500	NC_019695	GTT	2	6	24846	24851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205092

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